ATAC-Seq介绍

ATAC-seq （ Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）是使用高通量测序对 Tn5 转座酶可接近的核染色质区域进行测序分析的一种研究技术；该技术由美国斯坦福大学的研究人员开发，2013 年首次发表在 Nature Methods（Buenrostro et al., 2013）。通过转座酶对特定时空下开放的核染色质区域进行切割，获得在该时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。

应用领域

1. ATAC-seq 技术可以进行样本之间差异的染色质开放位点的比较，通常并不单独使用。作为检测表观遗传-染色质开放状态现象的方式，与样本基因表达谱紧密相连，从靶标基因的表观状态关联到表达水平，具有强大的数据挖掘作用。
2. 通过关联基因组、外显子，染色质免疫共沉淀（组蛋白修饰或转录因子结合）测序信息，形成：表观调控-基因组-基因表达的完整调控链。

技术优势

时间短：ATAC-seq实验过程短，从实验到分析最快可达2周
低细胞量需求：适合对细胞量少、难以收集的样品进行研究
覆盖度高：可以检测出全基因组范围内的开放染色质区域，获得调控序列信息

实验流程