技术应用(联合longRNA-seq)技术优势1. 识别处于翻译转态的RNA分子,准确描绘翻译中的核糖体图谱 2. 样本量要求更低,可低至单细胞水平 3. 高精度的活跃核糖体图谱,达到单碱基分辨率 技术流程送样要求样本类型: 1.细胞,≥ 1×106 个细胞 / 样本 2.组织,≥ 50mg/ 样本 样本物种:**人、大小鼠,更低样本量及其他物种请咨询评估 样品分组分析内容对照 longRNA-seq 分析 1. 数据质控 2. 基因比对与统计 3. mRNA 差异表达分析 4. lncRNA 差异表达分析 5. 差异基因 GO 分析 6. 差异基因 KEGG 分析 7. circRNA 差异表达分析 实测数据案例分析图7. 单细胞RiboLace与转录组测序,OOSP2处理后的翻译效率差异火山图 (active Ribo-seq): for组织≥ 50mg (注:【Active Ribo-seq /Ribo-seq测序项目推荐首选液氮速冻处理】,Cycloheximide处理会因为前处理操作时间过长导致组织降解的风险。) for细胞≥ 1*10^6(注:【Active Ribo-seq /Ribo-seq测序项目推荐首选液氮速冻处理】,Cycloheximide处理会因为前处理操作时间过长导致组织降解的风险。):Active Ribo-seq建议mRNA-seq 25万,active Ribo-seq 10万~100万,每个样分2管(mRNA-seq与active Ribo各1管)。 ***注意:active Ribo的组织不能用RNA later。 温馨提示:强烈建议实验设计具有生物学/技术重复。 |