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BSA混池测序

产品介绍

混池测序——即混合群体分离分析法(Bulked Segregant Analysis, BSA),是利用极端性状个体混池进行目标性状基因定位的一种快捷方法。在分离群体中,选取极端性状的子代DNA等量混合,对混合的“基因池”(GenePool)及亲本分别进行建库测序,计算不同文库的测序数据在多态位点(SNP)的频率(Allele Frequency,AF),与目标表型进行关联,从而实现目标性状相关的基因定位或者连锁分子标记的开发。


分析原理


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技术流程



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技术优势




1.大型动植物基因组分析经验丰富,深入挖掘生物群体意义;

2.流程优化,项目周期显著降低;

3.结合公共数据库样品信息联合分析,节省成本;

4.提供基因组数据构建服务,让数据后期利用更加便利。


送样要求




01
02

DNA总量≥500ng,浓度≥12ng/μl,无降解,无粘稠/颜色异常,无RNA/蛋白质污染;

使用无DNase管,标记清晰,干冰寄送。


分析示例

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期刊:Bmc Genomics      影响因子:4.547      发表时间:2019年

油菜(Brassica napus L.)突变体增加了每株植物的角果数目,但其分子机制仍不清楚。本研究结合BSA和全基因组重新测序(WGR)技术,使用来自近等基因系(NILs)zws-ms和zws-217研究与油菜多角果性状相关的基因组区域。


研究结果

1、遗传分析获得了与油菜多角果性状相关的3个SNP和2个InDel。

2、基于功能注释的结果,筛选鉴定出与油菜多角果性状相关的基因组区域和候选基因。

混3.png



混4.png

   


参考文献




发表时间

文章标题
杂志名
影响因子
合作单位
2021
Using Combined Methods of Genetic Mapping and Nanopore-Based Sequencing Technology to Analyze the Insertion Positions of   G10evo -EPSPS and   Cry1Ab/Cry2Aj   Transgenes in Maize
Frontiers in Plant Science
5.754浙江省农业科学院
2021
BrLETM2 Protein Modulates Anthocyanin Accumulation by Promoting ROS Production in Turnip (Brassica rapa subsp. rapa)
International Journal of Molecular Sciences4.556
东北林业大学
2019
Identification of genomic regions associated with multi-silique trait in Brassica napus.
BMC Genomics
3.594
四川农业科学院