产品介绍 混池测序——即混合群体分离分析法(Bulked Segregant Analysis, BSA,是利用极端性状个体混池进行目标性状基因定位的一种快捷方法。在分离群体中,选取极端性状的子代DNA等量混合,对混合的“基因池”(GenePool)及亲本分别进行建库测序,计算不同文库的测序数据在多态位点(SNP)的频率(Allele Frequency,AF),与目标表型进行关联,从而实现目标性状相关的基因定位或者连锁分子标记的开发。 分析原理 技术流程 技术优势 大型动植物基因组分析经验丰富,深入挖掘生物群体意义; 流程优化,项目周期显著降低; 结合公共数据库样品信息联合分析,节省成本; 提供基因组数据构建服务,让数据后期利用更加便利。 送样要求 DNA总量≥500ng,浓度≥12ng/μl,无降解,无粘稠/颜色异常,无RNA /蛋白质污染; 使用无DNase管,标记清晰,干冰寄送。 分析示例 标题: 与油菜多角果性状相关的基因组区域鉴定 研究背景: 油菜(Brassica napus L.)突变体增加了每株植物的角果数目,但其分子机制仍不清楚。本研究结合BSA和全基因组重新测序(WGR)技术,使用来自近等基因系(NILs)zws-ms和zws-217研究与油菜多角果性状相关的基因组区域。 研究结果: 1、遗传分析获得了与油菜多角果性状相关的3个SNP和2个InDel。 2、基于功能注释的结果,筛选鉴定出与油菜多角果性状相关的基因组区域和候选基因。
参考文献 1. Identification of genomic regions associated with multi-silique trait in Brassica napus. BMC Genomics, 2019. |