疫情当前,很多老师同学仍无法返校进行实验,科研产出受到不同程度影响。如何利用前期手头数据及丰富的网络资源,通过生信分析发表文章,不失为当前的一种高效方法。今年3月发表在《Database》杂志上的茶树SSR数据库文章,利用最近发表的茶树基因组鉴定出大量SSR标记。除了基因组序列外,研究者还从其他公开获得的序列如RNA-seq、GSS序列、ESTs和细胞器基因组(叶绿体和线粒体)中鉴定了SSR标记,并结合已发表文献,对一组经过验证的茶树SSR标记进行了分类。最后研究者利用分析获得的所有信息,开发了一个茶树SSR查询数据库--TeaMiD,它包含来自所有6种资源的SSR,包括3个茶树核基因组和17种野生茶树转录组序列等。 题目:TeaMiD: a comprehensive database of simple sequence repeat markers of teaTeaMiD:一个茶树简单序列重复(SSR)标记的综合数据库发表期刊:Database (Oxford) 发表时间:2020-3-11 影响因子:3.793