GC-MS全代谢组

全代谢组又称非靶向代谢组（Untargeted metabolomics），对样本进行全面的、无侧重的检测，通过比较实验组和对照组样本，找出差异代谢产物，结合生物信息分析，找出富集差异通路，整合代谢网络。全代谢组旨在提供一个全面的研究视角来比较差异，通常用于标志物的筛选、分子机制研究及多组学整合分析。

GC-MS全代谢组

GC-MS全代谢组学

1.       基因组的下游产物也是最终产物，是一些参与生物体新陈代谢、维持生物体正常生长功能和生长发育的小分子化合物的集合，主要是分子量小于1000的内源性小分子，GCMS非靶向是通过GCMS平台对限定条件下的特定生物样品中所有代谢组分的定性和定量。

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技术的优点

不同的处理方法：1、采用衍生化方案，适合检测极性较强的小分子代谢物；2、采用非衍生化方案，适合检测沸点较低的小分子代谢物；3、采用固相微萃取-顶空进样方案，适合检测易挥发的香味或风味物质。

实验流程

分析内容

送样要求

注：顶空进样的样本最少2g

仪器设备

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2. Aglient 7890B-5977A

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5. 1、代谢组研究相对于基因组和蛋白质组研究而言有什么不同之处？

6. 主要特点包括三方面：一、基因和蛋白表达的有效的微小变化会在代谢物上得到放大，从而使检测更容易；二、代谢组学的技术不需建立全基因组测序及大量表达序列数据库；三、因为代谢产物在各个生物体系中都是类似的，所以代谢组学研究中采用的技术更通用。

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2. 2、代谢组的样品重复性有什么要求？

代谢组学基于多元统计分析方法进行的，在样品准备上相对于转录组和蛋白质组而言需要更多的重复数据。一般建议植物样品：最少6次，建议8次生物学重复；

模式动物及微生物样品：最少8次，建议10次生物学重复；

临床样品：30次生物学重复以上，如组织样品不好取样，可控制在20次重复以上。

3. 3、靶向代谢检测平台的选择？

GC-MS和LC-MS两种平台各有优势，主要是由目标化合物的理化性质决定，GC-MS适合易挥发性、分子量不太大的化合物，而且，离子源为EI，碎片信息多，有成熟的图谱库，便于化合物检索，对于非挥发性成分则需要衍生化；而LC-MS离子源为APCI或者ESI源，适合做中等或强极性的化合物，分子量范围广，灵敏度高，前处理简单，但是LC-MS的价格要贵点，因此可以根据实际情况选择合适的检测平台。

4. 4、关于代谢组数据库问题，老师经常问起数据库是商业库还是自己建的库，类型？

GC-MS数据库：Nist、feihn；

LC-MS数据库：HMDB、Metlin、自建库。