所用技术作者合作单位区域文章标题发表期刊影响因子分区发表年份发表月份研究内容样本种属样本类型疾病类型科室解读链接PBA粟斌教授、姚琦教授团队首都医科大学附属北京佑安医院北京Proteomic profiling of single extracellular vesicles reveals association of CD31+ EV subpopulation with immune ...
线粒体线粒体在临床疾病研究中的意义重大，它们不仅在疾病的发生和发展中起着核心作用，而且在疾病治疗策略的开发中也是一个重要的焦点。线粒体疾病是由线粒体DNA（mtDNA）或核基因中的突变引起的，这些突变影响编码线粒体呼吸链复合体的基因12。线粒体功能障碍导致的能量代谢问题，是许多疾病的关键因素，包括癌症、衰老和神经退行性疾病。线粒体基因组含量mtDNA是一种环形、无内含子、双链、单倍体DNA链...
概念英文解释建库Library construction高通量测序前准备步骤。针对不同的研究目的建库方法不同。通常包括核酸样品检测、片段化、扩增、加接头、片段选择、纯化、浓度检测等步骤。插入片段Insert size插入片段大小，决定测序的长度。接头Adaptor接头，用于上机测序。建库时引入的接头序列与测序芯片（flow cell）上固定的接头相互识别。测序的标签Barcode/Index...
随着测序技术的不断发展，多组学联合日益成为解决科研问题的有力工具。但是多组学技术不是简单的“数据越多越好”，它们之间需要从不同的视角相互配合，这样才能把“前因”和“后果”都理清楚，从而解析出单组学看不到的东西。今天我们就来介绍一下WGBS、转录组、ATAC、ChIP-seq/CUT&Tag这几个技术放在一起怎么使用。一、四类数据分别回答什么问题在进行联合分析以前，我们需要先知道这四类数据各自...
研究背景随着抗逆转录病毒治疗（ART）的有效性和普及率的提高，HIV感染者的主要死因正逐渐从AIDS相关的机会性感染转向心血管疾病、癌症和代谢性疾病等慢性非传染性疾病（NCDs）。基于血浆蛋白组学数据精准识别AIDS相关及NCDs相关死亡的蛋白标志物，有望在未来的临床实践中实现对HIV感染者死亡风险的动态监测与早期识别，从而及时有效地实施精准干预，改善预后，减少死亡。新文速递复旦大学公共卫生...
尽管早期抗逆转录病毒治疗（ART）已将HIV由“致命判决”转变为可控慢病，但慢性炎症状态却构成了新的“隐形杀手”。流行病学数据显示，即便实现病毒持续抑制，HIV感染者（PWH）的卒中风险仍高达普通人群的1.5–2倍，且以缺血性卒中为主。尤为关键的是，在校正传统血管危险因素后，HIV感染依然是卒中的独立危险因素。不同于普通人群卒中涉及的炎症通路紊乱，HIV感染者体内存在更为剧烈的免疫激活与炎症...
研究背景 生物体内存在一个核心的功能传导与执行路径：基因 → mRNA → 蛋白质 → 代谢。这揭示了遗传信息如何通过转录、翻译最终影响细胞代谢活动的基本规律。具体而言，基因经转录成为mRNA，mRNA经翻译形成蛋白质，蛋白质执行生理功能的过程中（尤其是蛋白酶催化功能）产生代谢产物，而代谢产物又可以反向影响蛋白修饰与基因表达，形成高度动态的生物学闭环。在这条生命网络中，乳酸化被视为...
做转录调控、表观遗传方向的研究，“蛋白-DNA互作”几乎是绕不开的核心问题，面对实验室最主流的两个方案Cut&tag技术和Chip-seq技术，很多老师都会纠结到底该选哪一个？ 一 技术原理1、Chip-seq测序（染色质免疫共沉淀测序）的历史可以追溯到上世纪80年代，经过多年的打磨，至今仍是领域内公认的“金标准”。它的工作流程可以简单概括为：甲醛交联（把蛋白和DNA“冻在一起”，锁定互作关...
自身免疫性皮肤病是免疫系统异常攻击皮肤组织引发的疾病，常见类型包括红斑狼疮、银屑病、天疱疮、硬皮病、皮肌炎等，光照后导致发炎、泛红、起疹等，成为无数皮肤型红斑狼疮 (CLE)、皮肌炎 (DM) 患者的噩梦。然而，紫外线为何会精准“引爆”这类自身免疫性皮肤病，一直是皮肤病与免疫学界的未解之谜。近日，知名学术期刊Nature Immunology (IF=27.6) 在线发表重磅研究。研究人员直...
肝内胆管癌 (iCCA) 是一种具有高度侵袭性的恶性肿瘤，常在慢性炎症环境中发生。并且，高水平的白介素-6 (IL-6) 与患者不良预后密切相关。虽然肿瘤细胞自身可以产生IL-6并形成自分泌信号，但其对肿瘤生物学及肿瘤微环境 (TME) 的具体影响和作用机制一直未被深入研究。近期，来自丹麦哥本哈根大学生物技术研究与创新中心 (BRIC) 的Jesper B Andersen团队在知名期刊《G...
如何使用loupe对细胞进行手动定义段落引言做过单细胞测序的老师，应该都有一个比较头疼的事情吧，就是对细胞进行定义。虽然现在有很多方法可以对细胞类型进行自动化定义，但是基本还是需要手动校正一下。此外现在自动化注释多为针对人和小鼠，对于其他物种有时候并不是特别好处理，当然也可以通过同源注释的方式进行。今天我给老师们带来一种基于loupe和cellmarker2.0数据库下载的marker基因表...
一、文献基础信息期刊：Frontiers in Oncology（IF=5.7）发表时间：2023 年 7 月 3 日标题：Ascites-derived CDCP1+ extracellular vesicles subcluster as a novel biomarker and therapeutic target for ovarian cancer二、研究核心1. 研究样本卵巢癌...
一、文献基础信息期刊：Extracellular Vesicle发表时间：2022 年 6 月标题：Cell-derived nanovesicles prepared by membrane extrusion are good substitutes for natural extracellular vesicles二、研究核心：样本、方法、流程、结论1. 实验样本9 种癌细胞系：MD...
一、文献基础信息期刊：Life 发表时间：2024 年 3 月 20 日标题：Extracellular Vesicles as Next-Generation Biomarkers in Lung Cancer Patients: A Case Report on Adenocarcinoma and Squamous Cell Carcinoma二、研究核心1. 研究样本（Samples...
一、文献基础信息期刊：Translational Oncology（2024 年，IF≈5.0）标题：Plasma extracellular vesicles proteomics in meningioma patients二、核心研究要素1. 样本设计（Samples）血浆样本：66 例健康 / 非肿瘤对照组：26 例（三叉神经痛 / 面肌痉挛）脑膜瘤术前组（M0）：20 例脑膜瘤术后...
一、文献基础信息1. 核心信息期刊：ACS Omega（ACS 旗下权威综合期刊）发表日期：2021 年 8 月 5 日DOI：10.1021/acsomega.1c03248标题：Combined Analysis of Surface Protein Profile and microRNA Expression Profile of Exosomes Derived from Brai...
一、文献基础信息1. 核心信息期刊：Scientific Reports (Nature 子刊)发表日期：2024 年 6 月 26 日DOI：10.1038/s41598-024-60032-7标题：Macrophage‑derived CD36 + exosome subpopulations as novel biomarkers of Candida albicans infecti...
一、文献基础信息1. 核心信息期刊：Journal of Inflammation Research（JIR，炎症研究顶刊）发表时间：2025 年 12 月 23 日在线发表DOI：10.2147/JIR.S556255标题：Integrating Extracellular Vesicles Proteomics and Clinical Parameters to Develop a H...
一、基础信息1. 核心信息期刊：Extracellular Vesicles and Circulating Nucleic Acids (EV CNA)发表日期：2025 年 12 月 15 日DOI：10.20517/evcna.2025.93标题：A single-sEV analysis identifies plasma EPCAM+ sEVs as a biomarker for...
当前艾滋病主流治疗为抗逆转录病毒治疗（AntiRetroviral Therapy, ART），通过联合用药抑制病毒复制、修复免疫功能。研究证实，尽早启动 ART 有望实现功能性治愈，为患者带来新希望。目前尚无根治手段，但 ART 可有效管控病毒。临床观察到，部分患者停药后病毒会快速反弹，部分则能长期抑制，背后相关生物学机制仍有待探明。近期来自格拉德斯通研究所及加州大学旧金山分校的联合团队在...
