在过去的十年中,RNA测序(RNA-seq)成为差异基因表达、mRNA差异剪接等研究场景不可或缺的重要手段。随着高通量测序技术的不断发展,RNA-seq的研究技术、分析方法也在不断发展。现在RNA-seq用于研究RNA相关的各方面生物学问题,包括单细胞基因表达、RNA翻译、RNA结构、空间转录学、全转录组、RNA-蛋白互作等。对于RNA-seq我们需要决定是否以及如何去富集感兴趣的RNA。总...
LncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能 。1984年在小鼠中发现**个真核lncRNA——H19,长度为2.3 kb,并在胚胎发育过程中高表达 。此后越来越多的研究表明,lncRNA在众多生命活动过程中发挥重要作用,lncRNA开始引起人们广泛关注。相对于哺乳动物lncRNA而言,植物lncRNA研究相对落后,植物lncRNA研究也一直...
环状RNA(circRNA)是一类单链、共价闭合的RNA分子。在从病毒到动植物中普遍存在。与传统的线性mRNA 不同,circRNA 分子中不存在 5' cap 和 3' poly-A 尾。相反,分子两端之间的反向连接形成了环状结构,使其不受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解。CircRNA 具有多种生物学功能,包括 充当转录调节因、microRNA 海绵、RNA 结合蛋白 (RBP) ...
期刊:Frontiers in Microbiology 影响因子:5.640 发表时间:2022 样本类型:外耳道拭子客户单位:南京中医药大学佘万东课题组 一、研究背景耳霉菌病,也称外耳真菌性中耳炎,是由外耳道内致病真菌的入侵或过度传播引起的炎症性病变。本研究通过ITS测序鉴定了耳霉菌病的真菌群落,并评估联苯苄唑的治疗效果。二、实验设计在2020年和2021 年期间到江苏...
期刊:NPJ Biofilms Microbiomes 影响因子:7.290 发表时间:2021.07 样本类型:粪便、血液客户单位:汕头大学医学院**附属医院鄞国书课题组一、研究背景多囊卵巢综合征(PCOS)在育龄女性中患病率为6%-20%,是育龄妇女最常见的内分泌疾病,可能导致不孕。现代研究表明PCOS与代谢紊乱的高风险有关,如胰岛素抵抗、2型糖尿病、血脂异常和心血管疾病...
文章解读视频以下视频来源于Biomamba 生信基地,时长12:42主要内容Abstract有证据表明,代谢产物或肠道菌群参与了2型糖尿病(T2D)和糖尿病肾病(DKD)的发病机制。为了探讨T2D-DKD过程中血浆代谢组学与肠道微生物组学的相互作用,本研究采用液相色谱-质谱法分析了db/db小鼠血浆代谢组学,并采用16S rDNA和宏基因组测序技术在属水平上检测了肠道原核生物和全肠道微生物组...
转自凌恩生物期刊:ISME 影响因子:11.217 发表时间:2022样本类型:番茄根际土壤客户单位:南京农业大学一、研究背景大多农田土壤都不同程度地被植物病原体侵染。土壤传播的病原体可以在感染新宿主之前在土壤中潜伏数年。了解病害动态对于防止病原体传播至关重要。即使在同质条件下,面对土壤传播病原体的植物也往往表现出二元结果,个体要么保持完全健...
转自果壳生物自2006年发展至今,基因检测行业已逐步趋于成熟。在这样的背景下,Illmuina公司在2018年推出了专门针对亚洲人群的基因芯片Illumina Asian Screening Array(ASA)基因分型芯片。该芯片大大提升了基因芯片在亚洲人群中的准确性,目前Guoke Biotechnology主要有ASA芯片、ASA-CHIA芯片、ASA+MD芯片三款,接下来就和小编一起...
转自 中国组织工程研究杂志Nature Methods 如此评价类器官技术:利用类器官研究直接诱导生成三维组织模型,为人类生物学研究提供了强大的方法。类器官(Organoids),即是指它类似于组织器官。其实,它本身是一种基于3D体外细胞培养系统建立的,与体内的来源组织或器官高度相似的一种模型。这些3D体外培养系统可复制出已分化组织的复杂空间形态,并能够表现出细胞与细胞之间、细胞与其周围基质...
质谱流式细胞技术(Mass Cytometry,CyTOF)利用质谱原理对单细胞进行多参数检测的流式技术。通过对传统流式和质谱技术加以整合,它继承了传统流式细胞仪的高速分析的特点,又具有质谱检测的高分辨能力,并且克服了传统流式荧光发射基团光谱重叠的问题,是流式细胞技术一个新的发展方向。质谱流式与单细胞转录组测序相比,质谱流式技术能够直接获得蛋白水平的信息,捕获检测的细胞也更多信息更丰富。St...
爆红的类器官类器官(Organoid)是器官特异性细胞的集合,这些细胞从干细胞或器官祖细胞发育而来,并能以与体内相似的方式经细胞分序(cell sorting out) 和空间限制性的系别分化而实现自我组建。2009年Hans Clevers实验室用小肠干细胞首次培育出具备小肠绒毛和隐窝结构的类器官2013年被Science杂志评为“年度十大突破性进展”2017年被Nature Method...
ZAODX世界肿瘤早筛大会聚焦全球早筛前沿技术研发和转化应用,从“世界格局”、“中国探索”、“解决方案”三大角度,围绕着“科技力”、“生产力”、“市场力”三大方面进行深入探讨,构建全球**交流平台,帮助产业提升全球化合作能力和科技成果市场转化应用能力。7月15-7月17日,广州长隆国际会展中心,早筛领域的科学家、企业家、行业从业者等各界人士共同参会,线上+线下结合共商肿瘤早筛行业发展前景,并...
研究背景循环血浆蛋白质组在人类生物学功能和功能障碍中起着重要作用,是许多药物作用靶点,也是心血管疾病发生关键因素。已有基因组/血浆蛋白质组研究主要集中在欧洲人群,本次解读Circulation新作主要对非裔族群的全基因组序列和血浆蛋白质组进行分析,来提升识别新的遗传决定因素的能力。近期美国波士顿贝斯以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess Medical Center...
设备名称: BD FACSAria III cell sorter(流式细胞分选仪)联系电话:13296073158 (微信同号) 邮箱:yunbios@163.com流式细胞技术(flow cytometry,FCM)是利用流式细胞仪进行的一种单细胞定量分析和分选技术。是一种在液体系统中,测定单个细胞或细胞器的生物、物理和化学特性,并根据这些特性将所需要的细胞或细胞器进行定量分析...
海洋生物样本的单细胞测序理论上可以做,但成功率一直很低,因为海洋生物细胞的多种特性制约了单细胞测序实验的正常进行。通过比较目前***的两个商业化单细胞研究平台BD Rhapsody和10X Genomics,我们的结论是BD Rhapsody平台更适合进行海洋生物单细胞测序的研究。01BD平台开展海洋生物单细胞研究的优势盐离子浓度、金属离子浓度以及其它干扰物质10x Genomics平台是将...