**步:安装软件主体
下载VGenomics_RS_V1.1.0x64.setup.exe,安装,点击这里查看安装说明!
本地下载 百度网盘
第二步:安装KO数据文件(KEGG功能注释)
下载database.zip,并在软件安装根目录进行解压,点击这里查看配置说明!
按上述两个步骤,完成VG转录组软件的完整安装(推荐)。如果不需要KEGG功能注释,可以不执行步骤二。
下载,申请15天试用!关注 "VG生信软件" 公众号,获取激活码,額外增加45天 试用期限! 点击这里了解详情!
测试数据ref-based_test_rawdata.zip,相比软件自带测试数据,数据量相对更大一些。 点击这里查看测试数据详细信息!
功能全面:分析内容一网打尽!
权威度高:分析模块均源于公开发表的文献中,广受认可的算法和开源程序!
简单易上手:可视化操作,零基础、无需命令行和编程技能!
快速、高效:一键化完成分析,一键化导出网页结果!
个性化操作:个性化修改样品名、分组信息、个性化编辑数据和图片!
配置要求低:普通电脑配置(8G,2核),即可运行!
第一步:公共数据库获取转录组分析所需相关文件操作说明文档
第二步:比对和定量流程说明文档
64位Windows操作系统:Windows 7、Windows 8、Windows 10。
最低8G内存、2核心CPU电脑;推荐16G内存,4核心CPU电脑。
安装和试用
教学视频
模块帮助文档
基本操作说明
FAQ
数据管理和分析系统
关注公众号活动
增加数据预处理环节,与Ensembl基因组数据库网站实现无缝对接。 可以直接下载Ensembl 网站上的参考序列、注释信息等数据进行转录组分析, 点此查看具体操作步骤说明(重点)!
增加基于Diamond的KEGG功能注释,需要下载相应的KO数据库, 点此进行下载配置!
优化所有定量分析流程,统一输出Count矩阵、FPKM矩阵、TPM矩阵。
增加Kalliso(alignment-free)定量功能,能够极大地提升定量分析速度,建议使用。
增加T检验、秩和检验、方差分析等单一变量统计分析模块。
增加共表达网络分析、随机森林、SVM支持向量机、logistic回归、ROC曲线等多元统计分析模块。
大量分析模块功能和帮助文档优化。
兼容性优化,BUG修复,提升软件运行健壮性。