产品介绍

病毒（Virus）由一种核酸分子（DNA或RNA）与蛋白质（Protein）构成或仅由蛋白质构成（如 朊病毒）。根据遗传物质的组成，将所有已知的病毒分为DNA病毒——单链DNA病毒，DNA病毒——双链DNA病毒，DNA与RNA反转录病毒，RNA病毒——双链RNA病毒，RNA病毒——单链、单链RNA病毒、裸露RNA病毒及类病毒等八大类群。此外，还增设亚病毒因子一类。目前病毒约4000种，设有三个病毒目，64个病毒科，9个病毒亚科，233个病毒属，其中29个病毒属为独立病毒属。亚病毒因子类群，不设科和属。包括卫星病毒和prion（传染性蛋白质颗粒或朊病毒）。一些属性不很明确的属称暂定病毒属。

病毒根据宿主类型的不同，可以分为噬菌体（细菌病毒）、植物病毒（烟草花叶病毒）和动物病毒（如禽流感病毒、天花病毒和HIV等）。

病毒基因组结构简单，一般只含有单一核酸，在探究病毒的毒力系统、病毒的基因组进化与演变历程方面意义深远，可以为揭示病毒流行病变化趋势等提供有力参考。

病毒全基因组测序，是指基于第二代高通量测序技术，对病毒全基因组进行测序，利用生物信息分析手段，得到病毒的全基因组序列，解析编码信息，并获得相应的变异信息。

技术流程

送样要求

1、分析病毒感染样本血清，-80 ℃保存，干冰运输；

2、DNA/cDNA总量≧2ug，浓度≧100ng/ul，无降解，无粘稠，无颜色异常，无RNA/蛋白质污染；干冰寄送，使用无DNase管存放，标记清晰。

应用范围

对全新的病毒进行测序，获得框架图/完整序列；

对基因组已知的病毒进行基因组重测序，进行多态性分析；

基因预测、功能注释和比较基因组学(SNP、InDel. Pan-genome) 分析；

多种基因预测软件确保基因预测的准确性；

分析示例

全基因组图谱

全基因组结构变异类型配对图

物种间进化树

项目经验：

1. A newly recorded Rickettsia of the Torix group is a recent intruder and an endosymbiont in the whitefly Bemisia tabaci. Environmental Microbiology (IF=5.147), 2020.

2. Epidemiological investigation and genomic characterization of Caprine herpesvirus 1 from goats in China. Infection. Genetics and Evolution (IF=2.611)， 2019.

3. Isolation and characterization of a bacteriophage and its potential to disrupt multi-drug resistant Pseudomonas aeruginosa biofilms. Microbial Pathogenesis (IF=2.581), 2019.

4. Complete genome analysis of the novel Enterococcus faecalis phage vB_EfaS_AL3. Archives of Virology (IF=2.261), 2019.

5. Isolation and characterization of a bacteriophage and its potential to disrupt multi-drug resistant. Microbial Pathogenesis (IF=2.332), 2019.