环状RNA(circular RNA,circRNA)是在转录过程中,通过可变剪接形成的一类首尾相接的环状RNA分子。高等动物中circRNA的种类和含量远远超过预期。最近的研究发现circRNA可以作为“microRNA海绵”,即竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA),结合胞内miRNA,阻断miRNA对其靶基因的抑制作用。circRNA也可与蛋白形成复合体调节下游的靶基因。另外,circRNA的表达呈现出很强的组织特异性,也暗示circRNA具有重要的生物学功能。基于Illumina HiSeq平台的circRNA测序能够快检测样本中circRNA的种类并进行表达定量,结合生物信息学挖掘手段,研究circRNA的功能和调控机制。
样本要求
实验流程 实验设计——样本取材——RNA抽提——rRNA去除——线性RNA消化——文库构建——测序——数据分析
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