环状RNA（circular RNA，circRNA）是在转录过程中,通过可变剪接形成的一类首尾相接的环状RNA分子。高等动物中circRNA的种类和含量远远超过预期。最近的研究发现circRNA可以作为“microRNA海绵”，即竞争性内源RNA（competing endogenous RNA，ceRNA），结合胞内miRNA，阻断miRNA对其靶基因的抑制作用。circRNA也可与蛋白形成复合体调节下游的靶基因。另外，circRNA的表达呈现出很强的组织特异性，也暗示circRNA具有重要的生物学功能。基于Illumina HiSeq平台的circRNA测序能够快检测样本中circRNA的种类并进行表达定量，结合生物信息学挖掘手段，研究circRNA的功能和调控机制。

环状RNA特点

1. 大多存在于细胞质中，且序列高度保守；

2. 一般细胞或组织中，环状RNA较稳定，半衰期在48h，其他mRNA（线性）半衰期约为10h。

3. 不同细胞中表达的环状RNA可能不同；

4. 同一个基因可能即产生线性mRNA，又可以转录成环状RNA;

5. 总量估计，外显子环状RNA（exonic circRNA）的量约为polyA mRNA（线性mRNA）的1%；占所有非核糖体RNA的0.8%；

6. 大部分为ncRNA。

样本要求

• 样本类型：细胞、新鲜组织或足量total RNA

• 样品量：≥5ug纯化后的total RNA（需保证提供的细胞及组织样本可以提取到足量RNA），最低浓度不低于50ng/µl

• 样本质量：OD 260/280值应在1.9～2.2 之间；DNA 应该去除干净，RNA无降解；RIN值大于等于7

• 样品保存运输：RNA用离心管保存，封口膜封口后用干冰运输，组织样品则用冻存管保存，干冰或液氮运输

实验流程

实验设计——样本取材——RNA抽提——rRNA去除——线性RNA消化——文库构建——测序——数据分析

数据分析

数据分析内容列表